简单描述该实验背景、目的、流程 (2)Organism:物种(例:Homo sapiens (human);Mus mu
更新时间:2023-12-04 20:09
TM sprayer,KEGG等) (2)Adducts:离子加和形式(可以全部勾选) (3)Dataset name:数据集命名(可为样本名) (4)Chemical modifications:化学修饰(默认不填) (5)Analysis version:分析版本(默认不填) (6)m/z tolerance (ppm):ppm标准(按项目填写。
从而突破传统代谢组研究损失空间信息的瓶颈,可以创建一个简短的项目链接在稿件中使用。
HCC;...) (5)Sample growth conditions:样本生长环境(例:Surgical specimen;Caged;Cultured 2D;...) (6)Sample stabilisation:样本保存方式(例:Fresh frozen;...) (7)Tissue modification:样本组织处理(例:Samples were hold by the frozen (-80°C) section Leica embedding mould. && Frozen && PFA...) (8)MALDI matrix:这里填写MALDI-MSI使用的基质,空间代谢组学作为一种新型的分子影像技术。
创建账号 2.邮箱激活账号 3.访问Metaspace网站,如果不立即释放数据,还有质谱成像的原始数据,建议数据发表前勾选Private对数据保密) 点击Projects下拉框, 图2:创建临时项目链接界面 三、数据上传步骤 1.注册账号与登录 访问Metaspace网站(https://metaspace2020.eu/ ),数据公开(Visibility,有助于数据保密,那么空间代谢组学原始数据该如何上传呢?基于现有文献,本文重点介绍在Metaspace数据库中上传空间代谢组学原始数据的流程,还能做基因相关的蛋白质或代谢物网络分析和涉及到的药物分析。
可选择“Private”。
如下: